Sejak berdiri sampai sekarang telah beberapa kali terjadi pergantian kepala sekolah. Secara rinci adalah sebagai berikut:
No Tahun Nama Kepala Sekolah
1. 1950-1955 RM. Sukirmo 2. 1955-1963 Widiyarto 3. 1964 Y. Suprapto 4. 1964 Ant. Sariyo 5. 1964-1977 Y.Sulahyo 6. 1977-1986 YG. Sutarno,B.A. 7. 1986-1994 MG. Subandiyah 8. 1994-1999 FB. Sutardjo, B.A. 9. 1999-2004 Drs. J. Sarwo 10. 2004-2008 H. Tri Rahadi, BSc. 11. 2008 - 2013 Y. Daru Putranta, S.Pd.12. Tahun 2013 sampai sekarang Yohanes Nugraha Dwiyana Putra, ST biasa dipanggil Pak Jho.
